疾病易感基因检测报告的解读需要从基因、临床症状、ACMG评级、遗传方式、家族史等方面进行综合分析。下面,
香港基因检测中心就以下图为例:

①RAD21 (NM_006265):RAD21代表发生变异的基因,NM_006265代表转录本号。
由于不同转录本中对同一个位点的描述(包括核苷酸、氨基酸的位置)是不同的,因此在报告中同样会标注核苷酸、氨基酸的位置所对应的转录本,方便位点的查找及核对。
②chr8:117870653:chr8表示变异基因在8号染色体;117870653表示发生的突变位点位于8号染色体上的117870653位置。
③核苷酸变化:c.415_419del,代表415到419的5个碱基缺失。
其他核苷酸变化类型,包括:
▪ 替换:c.415A>G,代表A碱基被G碱基替换
▪ 重复:c.415_419dup,代表415到419碱基的重复
▪ 插入:c.415_419insAGC,代表AGC序列插入到415与419核苷酸之间
▪ 缺失-插入:c.415_419delinsAG,代表415到419之间5个碱基发生了缺失,同时插入了AG两个碱基
④ 氨基酸变化/变异分类:一般来说,3个核苷酸密码子对应编码一个氨基酸。如果核苷酸发生变化,可能会导致氨基酸发生变化:
▪ 移码变异:c.415_419del,p.Arg139GlyfsTer19,代表因415到419的5个碱基缺失,使编码的第139位Arg(精氨酸)开始发生改变,在改变后的第19个Gly(甘氨酸)终止。
▪ 错义变异:c.415G>A,p.Asp139Asn,代表第415位G碱基被A碱基替换,导致Asp(天冬氨酸)变为Asn(天冬酰胺)。
▪ 无义变异:c.415G>A,p.Asp139Ter,代表第415位G碱基被A碱基替换,导致该基因的第139个氨基酸由Asp(天冬氨酸)变为终止密码子。
▪ 同义变异:c.415G>A,p.Asp139Asp,代表第415位G碱基被A碱基替换,但该基因的第139个氨基酸没有发生改变。
▪ 剪接位点变异:c.415+5T>A,—,代表该基因编码序列第415位碱基的第5个碱基T变异为碱基A,但没有直接导致氨基酸的变化。
▪ 框内变异:c.415_419del,p.Glu138_Glu139del,代表因415到419的5个碱基缺失,导致138和139位的氨基酸缺失。
⑤ 变异类型:杂合,代表基因座上含有两个不同的等基因的个体。
其他变异类型,包括:
▪ 纯合:基因座上含有两个相同的等位基因的个体
▪ 半合子:半合子具有二组相同的染色体组,但有一个或多个基因是单价的,没有与之相对应的等位基因
⑥ ACMG评级:2015年由国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)编写和发布了《ACMG遗传变异分类标准与指南》。该指南将变异位点的致病、良性证据列为具体的28条评判标准,产生五个类别的致病性分类:致病,可能致病,临床意义不明,可能良性,良性。
该指南是多学科专家基于大量临床案例和丰富经验建立的,可以为分析受检者位点的致病性提供一定参考,但考虑到个体情况不同,不能统一分类,更不能作为致病性判断结论,需要同时结合受检者的临床症状、遗传方式、家族史等方面综合判断。
⑦ 家系来源验证:对比父亲、母亲等其他家系成员的基因情况,判断受检者的位点是遗传自谁。
⑧ 入选理由:临床症状与变异基因相关疾病表型相匹配的关键字。
⑨ 遗传方式:不同疾病的遗传方式也不同,大致分为:
▪ 常染色体显性遗传(AD):杂合变异可导致发病
▪ 常染色体隐性遗传(AR):纯合或复合杂合变异可导致发病
▪ X连锁显性遗传:女性杂合可导致发病,男性半合子导致发病
▪ X连锁隐性遗传:男性半合子发病
▪ Y连锁遗传:变异发生在男性的Y染色体上,只能从父亲传给儿子
▪ 线粒体遗传:母系遗传,只有女性能够通过线粒体遗传给子代,父亲不会把疾病传递给子代
以上就是关于“疾病易感基因检测报告怎么看”的内容,在分析检出位点致病性时,往往需要结合受检者本身的临床症状及家系成员的位点携带情况及其临床症状结合分析,因此香港基因检测中心建议,做疾病易感基因检测时,尽量提供详细的临床信息及家族史、家系样本进行来源分析,有利于致病性的判断及提高检出率。