一般来说,疾病基因检测报告的主体内容包含:
● 基本信息:受检人的个人信息和送检信息,包括姓名、年龄、性别、门诊/住院号、简要病史、送检科室、送检医师、检测项目、送检时间、样本类型、样本编号等。
● 检测结果:阳性结果会列出检测到的基因变异相关信息,阴性结果即为未检测到。
● 结果说明:对检测到的基因变异的说明和致病性评级。
● 分析意见:实验室针对检测结果给出的初步结论和建议。
● 疾病信息:对于检出疾病临床特征的简要描述。
拿到疾病基因检测报告时,该怎么看?
Step 1 先观察报告中最核心的内容,即:
a. 基因:哪个基因发生变异。
b. 合子类型:有性生殖生物的雌雄胚子结合后形成新的细胞统称为合子。根据两性配子的基因型和基因位置的相同与否,合子可分为:
• 纯合:即两个等位基因相同位置存在相同变异。
• 复合杂合:即两个等位基因都发生变异,但变异位置不同。
• 杂合:即两个等位基因只有一个发生变异。
• 半合子:属于一种特殊情况,如男性的X染色体是没有等位基因的,当男性X染色体基因发生改变称为半合子变异。
• 野生型:无基因变异。
c. 疾病名称:检测到的基因所对应的临床疾病。
需注意的是,一个基因通常会对应几种疾病,而一种疾病也会关联不同基因
d. 致病性:根据《ACMG遗传变异分类标准与指南》,变异可划分为5个等级,分别为致病(Pathogenic)、可能致病(Likely Pathogenic)、意义未明(Uncertain)、可能良性(Likely Benign)和良性(Benign)。
一般来说,结果为Pathogenic或Likely Pathogenic,代表致病的可能性比较大;而Uncertain,则代表,目前来看致病性证据不足,但是不能排除,需要根据临床进一步核实;而Likely Benign或Benign的位点一般不会放到报告中。
Step 2 留意报告中其他重要内容
a. 染色体位置:即变异在染色体的位置,如chr19:39214722,即变异位置在第19号染色体的第39214722位碱基。
b. 转录本:转录本是由一条基因通过转录形成的一种或多种可供编码蛋白质的成熟的mRNA。由于不痛转录本中对同一个位点的描述(包括核苷酸、氨基酸的位置)是不同的,因此报告中会标注出核苷酸、氨基酸位置对应的是具体哪个转录本,方便变异位点的查找即核对。
c. 核苷酸改变/氨基酸改变:根据HGVS规则命名的核苷酸变化/氨基酸变化。核苷酸有A、T、C、G四种且有固定的排列顺序,如果第211号位置发生改变,即原本的A被C取代,便会写作:c.211A>C。此外,相应的氨基酸有20种,也有固定的排列,如果第78号位置丝氨酸(S)被酪氨酸(Y)取代了,可以写作:p.S78Y。
d. 频率:指该位点在正常人数据库中的频率,通常携带的频率越高,致病的可能性就越小。
e. 遗传方式:常见的是常染色显性遗传(AD)、常染色体隐性遗传(AR)、X连锁显性遗传(XLD)和X连锁隐性遗传(XLR)等。
最后,香港基因化验表示,不同基因检测中心所提供的报告可能会略有不同,因此上述内容仅供参考。此外,无论报告是阳性结果还是阴性结果,均不能完全确认/排除被检者100%患(或不患)病,因此,拿到报告后应尽快到医生处复诊,并请临床医生进行综合的诊断。