这个问题比较复杂,Medtimes一时三刻很难解释清楚个中缘由,但可以给大家提供判读
癌症基因检测结果的四个要点:
1. 基本信息
拿到
癌症基因检测报告,首先要了解报告上的基本信息,包括:诊断信息、样本类型、取样部位、取样手段、用药史等。
2. 丰度
在肿瘤学中,所谓EGFR基因突变的分子丰度并没有统一的定义和标准,一般指突变型EGFR突变基因相对或绝对定量值。后来研究者将丰度定义为突变分子数在总的DNA中所占浓度。
丰度高低与样本、检测方式、质控等相关。
如大部分晚期患者通过气管镜或穿刺取材,如果病灶组织有包块,或组织炎性肉芽混合别的成分,测不出丰度也不是少见状况。
另外,多线治疗患者由于穿刺存在困难或肿瘤异质性明显,多用胸水或血液标本。但体液样本队CNV的检测敏感性明显低于突变、重排等变异形式,或因肿瘤负荷低,导致基线ctDNA含量差异,因此会出现不同样本类型的丰度差异很大。
因此,对于已经接受治疗出现进展的患者,有条件情况下应该是“哪里有进展,取哪里的样本”;同时也不必过分在意丰度高低,而应将丰度变化作为动态监控,通过变化趋势预测当前治疗效果。
3. 基因变异级别和药物证据等级
按照临床意义,基因变异级别的重要性及其药物证据可分为四个等级:
• Ⅰ类变异:具有明确临床意义的变异。(具有A级或B级药物证据)
药物证据:
A级:FDA(美国食品药品监督管理局)批准或专业临床指南推荐;业界指南中定义的特定肿瘤诊断/预后因子。
B级:经过具有足够统计学效能的临床研究证实,并获得该领域专家的共识;经过具有足够统计学效能的临床研究证实其诊断/预后价值。
• Ⅱ类变异:具有潜在床意义的变异。(具有 C级或D级药物证据)
药物证据:
C级:其他癌种中的A级证据(跨适应证用药,即其他癌种用药)、或已作为临床试验的入组标准;多项小型研究支持其诊断/预后价值。
D级:临床病例报道或临床前证据支持,小型研究或个案报道提示其辅助诊断/预后价值(独立或联合其他标志物)。
• Ⅲ类变异:临床意义不明。
药物证据:
在全人群或特定人群数据库中、泛癌种或特定肿瘤数据中均未观察到较高变异频率;缺乏令人信服的已发表肿瘤相关证据。
Ⅳ类变异:已知无临床意义。(无害或可能无害)
药物证据:
全人群或特定人群数据库中观察到高变异频率;无已发表的肿瘤相关证据。
对于多基因变异、特别是多个潜在驱动变异共存的情况,要结合肿瘤类型、既往治疗史、相对突变丰度、既往分子检测结果等信息综合判读,以推测不同变异之间的逻辑关系,指导后续治疗。
4.肿瘤负荷突变
肿瘤负荷突变(TMB)即肿瘤基因组编码区包含的非同义突变的数量或密度(突变数/Mb),是肿瘤新抗原负荷的替代指标。简单来说就是,患者肿瘤组织中具有多少个基因变异,突变的基因越多,越有可能产生更多异常的蛋白,越有可能被免疫系统识破。
要评估TMB水平及其可信度,首先所选择的panel不能太小,否则无法准确测算TMB。除此之外,还需要通过TMB绝对值及该数值在已检测的肿瘤样本中的相对排序等。
理论上,TMB水平低,可能预示靶向效果相对较好;TMB水平高,则可能预示免疫治疗获益相对高。
5.微卫星不稳定性
微卫星不稳定性(MSI)检测对于多种实体瘤患者具有重要临床意义。多个研究表明,dMMR/MSI-H患者能够从免疫检查点抑制剂中获益,且不限癌种。因此MSI 成为了所有实体瘤中免疫治疗疗效的预测因子之一。
6. 质量控制
拿到癌症基因检测报告后,很多人都只会看“是否检测出明确突变”,而忽略以附录形式出现在报告主体内容后的“附加信息”。
一份报告的结果是否真实可靠,就是依赖于这些看似不起眼的“ 附加信息”,包括检测方法、检测内容、质控参数 、局限性说明等。
如今患癌人数逐年增加,普通人想要预防癌症,除了养成良好的生活习惯,为自己选购一份合适的
防癌体检方案,才能真正做到“早预防、早诊断、早治疗”,远离癌症的困扰。